（一）主要職責

　　負責全國地表水生態(tài)環(huán)境監(jiān)管工作，擬訂和監(jiān)督實施國家重點流域生態(tài)環(huán)境規(guī)劃，建立和組織實施跨?。▏┙缢w斷面水質考核制度，監(jiān)督管理飲用水水源地生態(tài)環(huán)境保護工作，指導入河排污口設置。

　　（二）內設機構

　　綜合處、重點流域生態(tài)環(huán)境監(jiān)督管理一處、重點流域生態(tài)環(huán)境監(jiān)督管理二處、重點流域生態(tài)環(huán)境監(jiān)督管理三處、飲用水水源與重大工程水質保障處